Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abce1P61222 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abce1P61222 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abce1P61222 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abce1P61222 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abce1P61222 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abce1P61222 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abce1P61222 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abce1P61222 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abce1P61222 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abce1P61222 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abce1P61222 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abce1P61222 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms