Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms