Protein–RNA interactions for Protein: P59114

Pcif1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcif1P59114 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms