Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vps33bP59016 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps33bP59016 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps33bP59016 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps33bP59016 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps33bP59016 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps33bP59016 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps33bP59016 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps33bP59016 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps33bP59016 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps33bP59016 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps33bP59016 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps33bP59016 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps33bP59016 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps33bP59016 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps33bP59016 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms