Protein–RNA interactions for Protein: P58749

Tm6sf1, Transmembrane 6 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm6sf1P58749 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tm6sf1P58749 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tm6sf1P58749 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tm6sf1P58749 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tm6sf1P58749 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tm6sf1P58749 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tm6sf1P58749 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tm6sf1P58749 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tm6sf1P58749 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tm6sf1P58749 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tm6sf1P58749 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tm6sf1P58749 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tm6sf1P58749 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tm6sf1P58749 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms