Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Paxbp1P58501 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms