Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms