Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lim2P56563 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lim2P56563 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lim2P56563 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lim2P56563 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lim2P56563 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lim2P56563 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lim2P56563 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lim2P56563 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lim2P56563 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lim2P56563 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lim2P56563 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lim2P56563 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lim2P56563 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lim2P56563 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lim2P56563 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms