Protein–RNA interactions for Protein: P56475

Gabrr1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrr1P56475 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabrr1P56475 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrr1P56475 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms