Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pex2P55098 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pex2P55098 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pex2P55098 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pex2P55098 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pex2P55098 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pex2P55098 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pex2P55098 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pex2P55098 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pex2P55098 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pex2P55098 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pex2P55098 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pex2P55098 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pex2P55098 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pex2P55098 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pex2P55098 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pex2P55098 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pex2P55098 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pex2P55098 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pex2P55098 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pex2P55098 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pex2P55098 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pex2P55098 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pex2P55098 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pex2P55098 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pex2P55098 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pex2P55098 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pex2P55098 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pex2P55098 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pex2P55098 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pex2P55098 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pex2P55098 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pex2P55098 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pex2P55098 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pex2P55098 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pex2P55098 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pex2P55098 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pex2P55098 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pex2P55098 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pex2P55098 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pex2P55098 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pex2P55098 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pex2P55098 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms