Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms