Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms