Protein–RNA interactions for Protein: P53994

Rab2a, Ras-related protein Rab-2A, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2aP53994 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms