Protein–RNA interactions for Protein: P50992

Atp4b, Potassium-transporting ATPase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp4bP50992 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp4bP50992 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp4bP50992 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms