Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FanccP50652 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FanccP50652 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FanccP50652 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FanccP50652 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FanccP50652 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FanccP50652 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FanccP50652 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FanccP50652 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FanccP50652 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FanccP50652 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FanccP50652 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FanccP50652 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FanccP50652 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FanccP50652 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FanccP50652 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FanccP50652 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FanccP50652 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FanccP50652 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FanccP50652 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FanccP50652 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FanccP50652 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FanccP50652 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FanccP50652 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FanccP50652 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FanccP50652 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FanccP50652 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FanccP50652 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FanccP50652 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FanccP50652 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FanccP50652 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FanccP50652 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FanccP50652 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FanccP50652 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FanccP50652 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FanccP50652 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FanccP50652 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FanccP50652 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FanccP50652 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FanccP50652 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FanccP50652 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FanccP50652 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FanccP50652 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FanccP50652 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FanccP50652 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FanccP50652 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FanccP50652 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FanccP50652 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FanccP50652 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FanccP50652 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FanccP50652 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FanccP50652 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FanccP50652 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FanccP50652 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FanccP50652 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FanccP50652 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FanccP50652 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FanccP50652 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FanccP50652 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FanccP50652 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FanccP50652 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FanccP50652 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FanccP50652 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FanccP50652 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FanccP50652 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FanccP50652 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FanccP50652 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FanccP50652 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FanccP50652 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FanccP50652 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FanccP50652 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FanccP50652 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FanccP50652 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FanccP50652 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FanccP50652 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FanccP50652 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FanccP50652 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FanccP50652 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FanccP50652 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FanccP50652 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FanccP50652 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FanccP50652 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FanccP50652 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FanccP50652 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FanccP50652 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FanccP50652 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FanccP50652 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FanccP50652 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FanccP50652 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FanccP50652 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FanccP50652 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FanccP50652 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FanccP50652 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FanccP50652 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FanccP50652 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FanccP50652 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FanccP50652 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FanccP50652 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FanccP50652 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FanccP50652 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms