Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SftpdP50404 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SftpdP50404 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SftpdP50404 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SftpdP50404 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SftpdP50404 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SftpdP50404 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SftpdP50404 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SftpdP50404 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SftpdP50404 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms