Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
VegfbP49766 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VegfbP49766 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VegfbP49766 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VegfbP49766 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
VegfbP49766 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VegfbP49766 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
VegfbP49766 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
VegfbP49766 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VegfbP49766 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VegfbP49766 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VegfbP49766 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VegfbP49766 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VegfbP49766 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
VegfbP49766 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VegfbP49766 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VegfbP49766 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VegfbP49766 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VegfbP49766 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VegfbP49766 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VegfbP49766 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VegfbP49766 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VegfbP49766 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VegfbP49766 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VegfbP49766 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VegfbP49766 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VegfbP49766 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VegfbP49766 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VegfbP49766 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VegfbP49766 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VegfbP49766 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VegfbP49766 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VegfbP49766 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VegfbP49766 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VegfbP49766 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VegfbP49766 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VegfbP49766 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VegfbP49766 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VegfbP49766 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VegfbP49766 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VegfbP49766 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VegfbP49766 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VegfbP49766 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VegfbP49766 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VegfbP49766 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VegfbP49766 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VegfbP49766 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VegfbP49766 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VegfbP49766 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VegfbP49766 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VegfbP49766 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VegfbP49766 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VegfbP49766 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VegfbP49766 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VegfbP49766 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
VegfbP49766 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VegfbP49766 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VegfbP49766 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VegfbP49766 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VegfbP49766 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VegfbP49766 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VegfbP49766 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VegfbP49766 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VegfbP49766 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VegfbP49766 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VegfbP49766 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VegfbP49766 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VegfbP49766 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms