Protein–RNA interactions for Protein: P48985

Atoh1, Protein atonal homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh1P48985 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Atoh1P48985 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Atoh1P48985 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Atoh1P48985 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atoh1P48985 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atoh1P48985 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atoh1P48985 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atoh1P48985 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atoh1P48985 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atoh1P48985 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atoh1P48985 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atoh1P48985 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atoh1P48985 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atoh1P48985 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atoh1P48985 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atoh1P48985 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atoh1P48985 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atoh1P48985 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atoh1P48985 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Atoh1P48985 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Atoh1P48985 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atoh1P48985 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Atoh1P48985 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Atoh1P48985 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atoh1P48985 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Atoh1P48985 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atoh1P48985 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atoh1P48985 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Atoh1P48985 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atoh1P48985 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Atoh1P48985 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atoh1P48985 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atoh1P48985 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atoh1P48985 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Atoh1P48985 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atoh1P48985 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atoh1P48985 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atoh1P48985 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atoh1P48985 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atoh1P48985 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atoh1P48985 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atoh1P48985 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atoh1P48985 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atoh1P48985 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atoh1P48985 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atoh1P48985 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Atoh1P48985 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atoh1P48985 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atoh1P48985 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atoh1P48985 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atoh1P48985 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atoh1P48985 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atoh1P48985 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atoh1P48985 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atoh1P48985 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atoh1P48985 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Atoh1P48985 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atoh1P48985 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Atoh1P48985 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atoh1P48985 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atoh1P48985 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atoh1P48985 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atoh1P48985 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atoh1P48985 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms