Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms