Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rfx2P48379 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rfx2P48379 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rfx2P48379 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rfx2P48379 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rfx2P48379 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rfx2P48379 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rfx2P48379 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rfx2P48379 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rfx2P48379 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rfx2P48379 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rfx2P48379 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rfx2P48379 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rfx2P48379 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rfx2P48379 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rfx2P48379 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rfx2P48379 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rfx2P48379 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rfx2P48379 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rfx2P48379 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rfx2P48379 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms