Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfx1P48377 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms