Protein–RNA interactions for Protein: P47915

Rpl29, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl29P47915 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl29P47915 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl29P47915 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl29P47915 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl29P47915 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl29P47915 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl29P47915 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl29P47915 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl29P47915 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl29P47915 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl29P47915 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl29P47915 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl29P47915 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl29P47915 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl29P47915 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl29P47915 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl29P47915 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl29P47915 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl29P47915 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl29P47915 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl29P47915 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl29P47915 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl29P47915 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl29P47915 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl29P47915 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl29P47915 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl29P47915 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl29P47915 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl29P47915 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl29P47915 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl29P47915 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl29P47915 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl29P47915 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl29P47915 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms