Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax9P47242 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax9P47242 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax9P47242 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax9P47242 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax9P47242 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax9P47242 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax9P47242 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms