Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pax7P47239 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax7P47239 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pax7P47239 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pax7P47239 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pax7P47239 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax7P47239 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pax7P47239 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pax7P47239 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pax7P47239 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pax7P47239 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms