Protein–RNA interactions for Protein: P43687

Hmx2, Homeobox protein HMX2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx2P43687 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hmx2P43687 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmx2P43687 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmx2P43687 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms