Protein–RNA interactions for Protein: P43135

Nr2f2, COUP transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f2P43135 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Nr2f2P43135 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr2f2P43135 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms