Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms