Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grik2P39087 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grik2P39087 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grik2P39087 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grik2P39087 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grik2P39087 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grik2P39087 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grik2P39087 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grik2P39087 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grik2P39087 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Grik2P39087 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Grik2P39087 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Grik2P39087 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Grik2P39087 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Grik2P39087 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms