Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col18a1P39061 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms