Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PpargP37238 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PpargP37238 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PpargP37238 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PpargP37238 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PpargP37238 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PpargP37238 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PpargP37238 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PpargP37238 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PpargP37238 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PpargP37238 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PpargP37238 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PpargP37238 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PpargP37238 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PpargP37238 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PpargP37238 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PpargP37238 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PpargP37238 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PpargP37238 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PpargP37238 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PpargP37238 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PpargP37238 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PpargP37238 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PpargP37238 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PpargP37238 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PpargP37238 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PpargP37238 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PpargP37238 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PpargP37238 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PpargP37238 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PpargP37238 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PpargP37238 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PpargP37238 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PpargP37238 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PpargP37238 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PpargP37238 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PpargP37238 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PpargP37238 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PpargP37238 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PpargP37238 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PpargP37238 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PpargP37238 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PpargP37238 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PpargP37238 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PpargP37238 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PpargP37238 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PpargP37238 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PpargP37238 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PpargP37238 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PpargP37238 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PpargP37238 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PpargP37238 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PpargP37238 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PpargP37238 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PpargP37238 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PpargP37238 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PpargP37238 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PpargP37238 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PpargP37238 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PpargP37238 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PpargP37238 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PpargP37238 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PpargP37238 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PpargP37238 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PpargP37238 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PpargP37238 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PpargP37238 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PpargP37238 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PpargP37238 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PpargP37238 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PpargP37238 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PpargP37238 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PpargP37238 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PpargP37238 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PpargP37238 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PpargP37238 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PpargP37238 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PpargP37238 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PpargP37238 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PpargP37238 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PpargP37238 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PpargP37238 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PpargP37238 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PpargP37238 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PpargP37238 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PpargP37238 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PpargP37238 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PpargP37238 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PpargP37238 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PpargP37238 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PpargP37238 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PpargP37238 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PpargP37238 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PpargP37238 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PpargP37238 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PpargP37238 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PpargP37238 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PpargP37238 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PpargP37238 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PpargP37238 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms