Protein–RNA interactions for Protein: P35918

Kdr, Vascular endothelial growth factor receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdrP35918 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KdrP35918 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KdrP35918 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KdrP35918 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KdrP35918 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KdrP35918 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KdrP35918 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KdrP35918 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KdrP35918 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KdrP35918 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KdrP35918 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KdrP35918 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KdrP35918 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KdrP35918 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KdrP35918 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KdrP35918 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KdrP35918 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KdrP35918 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KdrP35918 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KdrP35918 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KdrP35918 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KdrP35918 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KdrP35918 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KdrP35918 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KdrP35918 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KdrP35918 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KdrP35918 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KdrP35918 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KdrP35918 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KdrP35918 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KdrP35918 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KdrP35918 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KdrP35918 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KdrP35918 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KdrP35918 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KdrP35918 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KdrP35918 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KdrP35918 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KdrP35918 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KdrP35918 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KdrP35918 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KdrP35918 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KdrP35918 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KdrP35918 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KdrP35918 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KdrP35918 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KdrP35918 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KdrP35918 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KdrP35918 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KdrP35918 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KdrP35918 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KdrP35918 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KdrP35918 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KdrP35918 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KdrP35918 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KdrP35918 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KdrP35918 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KdrP35918 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KdrP35918 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KdrP35918 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KdrP35918 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KdrP35918 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KdrP35918 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KdrP35918 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KdrP35918 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KdrP35918 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KdrP35918 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KdrP35918 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KdrP35918 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KdrP35918 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KdrP35918 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KdrP35918 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KdrP35918 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KdrP35918 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
KdrP35918 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KdrP35918 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KdrP35918 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KdrP35918 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KdrP35918 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KdrP35918 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KdrP35918 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KdrP35918 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KdrP35918 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KdrP35918 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KdrP35918 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KdrP35918 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KdrP35918 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KdrP35918 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KdrP35918 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KdrP35918 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KdrP35918 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KdrP35918 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KdrP35918 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KdrP35918 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KdrP35918 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KdrP35918 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KdrP35918 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KdrP35918 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KdrP35918 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KdrP35918 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms