Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grin1P35438 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin1P35438 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin1P35438 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin1P35438 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Grin1P35438 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Grin1P35438 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Grin1P35438 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin1P35438 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin1P35438 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin1P35438 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin1P35438 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin1P35438 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin1P35438 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin1P35438 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin1P35438 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin1P35438 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin1P35438 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin1P35438 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin1P35438 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin1P35438 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin1P35438 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin1P35438 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin1P35438 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin1P35438 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin1P35438 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin1P35438 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin1P35438 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin1P35438 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin1P35438 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin1P35438 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin1P35438 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin1P35438 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin1P35438 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin1P35438 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms