Protein–RNA interactions for Protein: P35282

Rab21, Ras-related protein Rab-21, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab21P35282 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab21P35282 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab21P35282 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab21P35282 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab21P35282 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab21P35282 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab21P35282 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab21P35282 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab21P35282 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab21P35282 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab21P35282 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab21P35282 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab21P35282 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms