Protein–RNA interactions for Protein: P35279

Rab6a, Ras-related protein Rab-6A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab6aP35279 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms