Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ptk2P34152 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ptk2P34152 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ptk2P34152 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ptk2P34152 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ptk2P34152 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ptk2P34152 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ptk2P34152 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ptk2P34152 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ptk2P34152 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms