Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pola1P33609 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pola1P33609 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pola1P33609 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pola1P33609 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pola1P33609 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pola1P33609 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms