Protein–RNA interactions for Protein: P32972

Tnfsf8, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf8P32972 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf8P32972 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.7 ms