Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms