Protein–RNA interactions for Protein: P31315

Gsx1, GS homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx1P31315 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsx1P31315 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsx1P31315 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsx1P31315 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsx1P31315 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsx1P31315 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsx1P31315 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsx1P31315 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsx1P31315 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsx1P31315 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms