Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms