Protein–RNA interactions for Protein: P30681

Hmgb2, High mobility group protein B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb2P30681 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hmgb2P30681 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hmgb2P30681 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms