Protein–RNA interactions for Protein: P29416

Hexa, Beta-hexosaminidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HexaP29416 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HexaP29416 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HexaP29416 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HexaP29416 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HexaP29416 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HexaP29416 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HexaP29416 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HexaP29416 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HexaP29416 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HexaP29416 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HexaP29416 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HexaP29416 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HexaP29416 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HexaP29416 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HexaP29416 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HexaP29416 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HexaP29416 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HexaP29416 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HexaP29416 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HexaP29416 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HexaP29416 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HexaP29416 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HexaP29416 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HexaP29416 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HexaP29416 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HexaP29416 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HexaP29416 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HexaP29416 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HexaP29416 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HexaP29416 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HexaP29416 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HexaP29416 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HexaP29416 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HexaP29416 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HexaP29416 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HexaP29416 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HexaP29416 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HexaP29416 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HexaP29416 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HexaP29416 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HexaP29416 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HexaP29416 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HexaP29416 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HexaP29416 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HexaP29416 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HexaP29416 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HexaP29416 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HexaP29416 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
HexaP29416 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HexaP29416 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HexaP29416 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HexaP29416 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HexaP29416 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HexaP29416 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HexaP29416 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HexaP29416 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HexaP29416 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HexaP29416 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HexaP29416 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HexaP29416 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HexaP29416 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HexaP29416 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HexaP29416 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HexaP29416 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HexaP29416 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HexaP29416 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HexaP29416 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HexaP29416 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HexaP29416 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HexaP29416 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HexaP29416 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HexaP29416 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HexaP29416 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HexaP29416 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HexaP29416 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HexaP29416 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HexaP29416 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HexaP29416 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HexaP29416 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HexaP29416 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HexaP29416 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HexaP29416 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HexaP29416 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HexaP29416 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HexaP29416 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HexaP29416 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HexaP29416 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HexaP29416 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HexaP29416 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HexaP29416 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HexaP29416 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HexaP29416 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HexaP29416 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HexaP29416 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HexaP29416 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HexaP29416 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HexaP29416 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HexaP29416 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HexaP29416 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HexaP29416 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms