Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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Hoxd10P28359 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
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Hoxd10P28359 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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Hoxd10P28359 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms