Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms