Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa2P28309 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa2P28309 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa2P28309 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa2P28309 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa2P28309 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa2P28309 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa2P28309 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms