Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjc1P28229 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms