Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou2f1P25425 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou2f1P25425 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou2f1P25425 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou2f1P25425 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou2f1P25425 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou2f1P25425 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou2f1P25425 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou2f1P25425 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou2f1P25425 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms