Protein–RNA interactions for Protein: P23979

Htr3a, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3aP23979 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr3aP23979 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr3aP23979 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr3aP23979 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr3aP23979 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr3aP23979 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr3aP23979 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr3aP23979 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr3aP23979 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr3aP23979 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr3aP23979 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr3aP23979 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr3aP23979 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr3aP23979 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr3aP23979 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr3aP23979 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr3aP23979 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr3aP23979 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr3aP23979 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htr3aP23979 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htr3aP23979 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htr3aP23979 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htr3aP23979 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htr3aP23979 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htr3aP23979 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htr3aP23979 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htr3aP23979 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htr3aP23979 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htr3aP23979 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htr3aP23979 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htr3aP23979 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr3aP23979 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms