Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfyaP23708 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfyaP23708 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfyaP23708 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfyaP23708 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NfyaP23708 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfyaP23708 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfyaP23708 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms