Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcb1aP21447 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms